Se ubica a 60 km al noreste de la ciudad de Copiapó. Se accede por el camino internacional 31-CH que va desde Copiapó al paso San Francisco. A 101 km de Copiapó están las Vegas de San Andrés.

El Sitio Prioritario Qda. San Andrés tiene una superficie de 922,0 km². En el hay registradas 129 especies de plantas nativas. En categorías de amenaza se encuentran 2 especies En Peligro y 3 Vulnerables.